- 辦公廳（對臺(tái)灣農(nóng)業(yè)事務(wù)辦公室）
- 人事司（黨組巡視工作領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室）
- 法規(guī)司
- 政策與改革司
- 發(fā)展規(guī)劃司
- 計(jì)劃財(cái)務(wù)司
- 種植業(yè)管理司（農(nóng)藥管理司）
- 畜牧獸醫(yī)局
- 漁業(yè)漁政管理局
- 鄉(xiāng)村產(chǎn)業(yè)發(fā)展司（農(nóng)產(chǎn)品加工指導(dǎo)司）
- 鄉(xiāng)村建設(shè)促進(jìn)司
- 農(nóng)村社會(huì)事業(yè)促進(jìn)司
- 農(nóng)村合作經(jīng)濟(jì)指導(dǎo)司
- 幫扶司
- 區(qū)域協(xié)作促進(jìn)司（革命老區(qū)工作辦公室）
- 監(jiān)督檢查司
- 市場與信息化司
- 國際合作司
- 科學(xué)技術(shù)司（農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全管理辦公室）
- 農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)管司
- 農(nóng)墾局
- 種業(yè)管理司
- 農(nóng)業(yè)機(jī)械化管理司
- 農(nóng)田建設(shè)管理司
- 機(jī)關(guān)黨委
- 離退休干部局
- 長江流域漁政監(jiān)督管理辦公室
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部機(jī)關(guān)服務(wù)中心( 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部機(jī)關(guān)服務(wù)局 )
- 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
- 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院
- 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院
- 全國農(nóng)業(yè)展覽館（中國農(nóng)業(yè)博物館）
- 中國農(nóng)業(yè)電影電視中心
- 農(nóng)民日報(bào)社
- 中國農(nóng)業(yè)出版社有限公司（農(nóng)村讀物出版社）
- 中國農(nóng)村雜志社
- 全國鄉(xiāng)村振興宣傳教育中心
- 中央農(nóng)業(yè)干部教育培訓(xùn)中心（農(nóng)業(yè)農(nóng)村部管理干部學(xué)院、中國共產(chǎn)黨農(nóng)業(yè)農(nóng)村部黨校）
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部人力資源開發(fā)中心、中國農(nóng)學(xué)會(huì)
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)村經(jīng)濟(jì)研究中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部信息中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全中心
- 中國綠色食品發(fā)展中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部規(guī)劃設(shè)計(jì)研究院
- 中國鄉(xiāng)村振興發(fā)展中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部大數(shù)據(jù)發(fā)展中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部工程建設(shè)服務(wù)中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部財(cái)會(huì)服務(wù)中心、中華農(nóng)業(yè)科教基金會(huì)
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部對外經(jīng)濟(jì)合作中心（中國-歐洲聯(lián)盟農(nóng)業(yè)技術(shù)中心）
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)貿(mào)易促進(jìn)中心(中國國際貿(mào)易促進(jìn)委員會(huì)農(nóng)業(yè)行業(yè)分會(huì)、中國國際商會(huì)農(nóng)業(yè)行業(yè)商會(huì))
- 中國國際減貧中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部國際交流服務(wù)中心
- 中央農(nóng)業(yè)廣播電視學(xué)校(農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)民科技教育培訓(xùn)中心)、中國農(nóng)民體育協(xié)會(huì)
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技發(fā)展中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)生態(tài)與資源保護(hù)總站
- 中國農(nóng)村技術(shù)開發(fā)中心
- 全國農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣服務(wù)中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)藥檢定所（國際食品法典農(nóng)藥殘留委員會(huì)秘書處）
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部耕地質(zhì)量和農(nóng)田工程監(jiān)督保護(hù)中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)機(jī)械化總站
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- 中國動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心（農(nóng)業(yè)農(nóng)村部屠宰技術(shù)中心）
- 中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所（農(nóng)業(yè)農(nóng)村部獸藥評審中心）
- 中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心
- 中國農(nóng)墾經(jīng)濟(jì)發(fā)展中心（農(nóng)業(yè)農(nóng)村部南亞熱帶作物中心）
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)村社會(huì)事業(yè)發(fā)展中心（農(nóng)業(yè)農(nóng)村部鄉(xiāng)鎮(zhèn)企業(yè)發(fā)展中心）
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部鄉(xiāng)村振興監(jiān)測中心
- 全國水產(chǎn)技術(shù)推廣總站、中國水產(chǎn)學(xué)會(huì)
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部漁政保障中心
- 外交部
- 國防部
- 國家發(fā)展和改革委員會(huì)
- 教育部
- 科學(xué)技術(shù)部
- 工業(yè)和信息化部
- 國家民族事務(wù)委員會(huì)
- 公安部
- 國家安全部
- 民政部
- 司法部
- 財(cái)政部
- 人力資源和社會(huì)保障部
- 自然資源部
- 生態(tài)環(huán)境部
- 住房和城鄉(xiāng)建設(shè)部
- 交通運(yùn)輸部
- 水利部
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部
- 商務(wù)部
- 文化和旅游部
- 國家衛(wèi)生健康委員會(huì)
- 退役軍人事務(wù)部
- 應(yīng)急管理部
- 中國人民銀行
- 審計(jì)署
- 國家語言文字工作委員會(huì)
- 國家航天局
- 國家原子能機(jī)構(gòu)
- 國家外國專家局
- 國家海洋局
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- 國家鄉(xiāng)村振興局
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- 國家宗教事務(wù)局
- 國務(wù)院研究室
- 國務(wù)院僑務(wù)辦公室
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- 國務(wù)院臺(tái)灣事務(wù)辦公室
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